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华西生物医学大数据中心 West China Biomedical Big Data Center
作者:科研基地科编辑:科研基地科来源:科技部2021.11.12

研究方向:

1.  疾病的智能预警及预测干预研究


  • l  疾病的智能预警及预测干预
  • l  全生命周期健康管理
  • l  脑科学与类脑计算


2. 多组学数据智能医学研究


  • l  生物信息算法与分析系统
  • l  疾病发生发展分子机制


3. 健康服务与医学工程研究


  • l  康复、手术机器人、医学服务机器人
  • l  人工智能、医学图像、手术规划、电子病历
  • l  医疗人因工程、医学设备可靠性
  • l  生物力学、可穿戴传感器


4. 大健康数据挖掘与应用研究


  • l  队列建设
  • l  多源数据挖掘
  • l  突发重大公共卫生事件应对医保治理


5. 医院管理与卫生政策


  • l  医学大数据研究平台与安全治理研究室
  • l  数据标准质控研究数据
  • l  安全治理技术研究
  • l  数据安全合规研究


科室简介:

    四川大学华西生物医学大数据中心汇集了华西口腔医学院、临床医学院、药学院、公共卫生学院以及基础医学与法医学院的医学多学科优势、临床专科能力,凭借华西医学基础研究和四家附属医院的优质海量数据资源,在全生命周期健康促进理念下,围绕健康管理、临床医疗、慢病管理、健康养老四个阶段,集合四川大学理工科学院优质的专家与技术资源,以学科交叉的创新途径开展研究。争取在医学基础与理论、预防、诊疗与康复服务等方面实现“体系创新、技术创新、模式创新和管理创新”,推动川大华西医学整体率先进入世界一流。落实响应国家健康战略,在新发展理念的指引下,坚持“创新、开放、协同、共赢”原则,与校外企事业单位及科研院所一起,共同研究与转化研究,建立和践行“生物—心理—社会—环境”医学模式,构建新型(全生命周期)健康服务体系,满足不同层次的健康需求,促进人类健康,实现社会和谐,为实现健康中国战略、构建人类健康命运共同体贡献川大力量。承担四川大学双一流超前部署“医学大数据”学科和四川大学“医学+信息”中心建设任务,并已获批四川省科学技术厅“四川省医学大数据应用工程技术研究中心”、四川省发展和改革委员会“疾病流行病学大数据研究平台”。参与疾病分子网络前沿科学中心等国家级项目和平台建设。中心目前已建成硬件平台拥有PB级存储的高性能计算平台,可支持多方向的医学大数据与人工智能科研工作。


研究人员、研究方向简介

1)主任:张伟

    研究方向:疾病诊断与治疗决策,精神病与精神卫生学,卫生保险政策与医院管理

2)研究人员

①     姓名:陈润生(中国科学院 院士)

    研究方向:理论生物学、生物信息学、非编码RNA

②     姓名:李康

    研究方向:人工智能在生物力学分析和骨肌影像分析中的进展

③     姓名:宋欢

    研究方向:健康医疗数据库建设、应用与流行病学研究

④     姓名:赵屹

    研究方向:生命多组学数据、临床数据挖掘及人工智能算法研究

⑤     姓名:何顺民

    研究方向:生物信息学、非编码和表观遗传学

⑥     姓名:吕东昊


特色平台/设备

1. 科研大数据平台:

    科研大数据平台包含数据处理和科研应用两大中心,其中数据处理中心主要采用ETLNLP等技术对来自临床的业务系统数据进行清洗,包含数据建模、入库、装载、转换、脱敏等处理。目前已产出乳腺癌专病库、新冠专病库、结直肠癌专病库、抑郁症专病库、肾脏病专病库、食管癌专病库,并支持数据溯源及安全等级管理。科研应用中心则是在专病库数据的基础上,提供数据申请、资源申请、数据检索、数据挖掘分析、临床数据采集、项目管理、教培管理等应用工具。支持科研工作的顺利、高效开展,其中数据检索支持结构化的条件检索、事件检索、联合检索,以及非结构化数据的NLP分词检索。数据挖掘分析支持50+中常规分析算法、支持上传管理自定义分析算法。

2. 云平台:

    中心在新川前沿医学中心搭建了大数据中心私有云平台,以服务的方式为全院科研团队提供分析环境,云服务保障数据在云端统一管控,且具有高可靠、通用性强、高可扩展、便捷部署、使用高效的优势。

云平台分析主机:适用于电子病历等常规分析计算,2路计算节点20个,1PB存储,以windowslinux虚拟机的方式提供资源。使用方式为团队独占式使用。

3.  高性能计算集群(HPC):

    中心的HPC应用领域是计算密集型应用,可以支持基因组学分析、大型科学工程计算,数值模拟等场景。当前中心的HPC集群分为内网集群和外网集群两部分,总体计算节点包括4路计算节点、大内存节点、GPU节点三种类型,分别适配不同的科研分析需求。HPCWie统一linux系统,以任务模板提交作业方式使用,共享资源,用完释放。


位置:新川科技园成都前沿科学中心 D5-A 67楼/华西主院区 临床医学院第八教学楼 9007